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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 73 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 22 Mo |
Extrait
.
Ecole doctorale
"Sciences des procédésSciences des aliments"
Université Montpellier II
Thèse
pour obtenir le titre de
Docteur de l’Université d’Avignon et des Pays de Vaucluse
Discipline : Biotechnologie, Microbiologie
Julia ESBELIN
La protéine Fnr et le système à deux composants ResDE, il,
des régulateurs majeurs de la synthèse des des régulateurs majeurs de la synthèse des des régulateurs majeurs de la synthèse des
entérotoxines de Bacillus cereus iill
Soutenue publiquement le 2 juillet 2009 devant le jury composé de :
Président Mr. Philippe Schmitt - Professeur Université Avignon
Rapporteurs Mr. Didier Lereclus - Directeur de Recherches INRA
Mme Marie-Agnès Sari – Professeur Université Paris Descartes
Examinateurs Mr. Yves Jouanneau - Directeur de Recherches CNRS
Mr. Jean Armengaud - Chercheur-Ingénieur-HDR CEA
Directrice de thèse Mme Catherine Duport - Maître de conférence-HDR Avignon
Université d’Avignon et des Pays de Vaucluse, UMR A408, Sécurité et Qualité des
Produits d’Origine Végétale, INRA, Avignon
tel-00410526, version 2 - 5 Feb 2010 Remerciements.
Remerciements
A tous ceux qui ont influencé ma vie, de près ou de loin, et qui font ou ont fait
ce que je suis aujourd’hui, MERCI.
En commençant par mes parents. Merci de m’avoir encouragé dans mes études,
de m’avoir toujours soutenue et de vous être intéressés à mes travaux.
Merci à mes grands-parents pour leur amour et leur soutien et un merci plus
particulier à ma petite mamie qui a lu et relu chacune des lignes de ce mémoire
afin d'en extraire les fautes d'orthographes.
Je remercie ma petite sœur (ma popote). Je suis sûre que tu es aussi fière de
moi que moi de toi. Ça était si dur d’être loin de toi tout ce temps, j’espère être
à nouveau vite près de toi.
À vous tous, merci, JVAPQTAM !!!
Doudou, je te remercie pour ton soutien moral dans les mauvais comme dans les
bons moments. Merci pour ta patience, ton écoute et ton amour. Merci d’être
aussi fort et de savoir si bien gérer mes angoisses. Ce n’était pas toujours facile,
mais merci d’avoir été là et d’avoir franchi cette étape avec moi. Le meilleur
reste à venir!
J’adresse mes sincères remerciements aux membres du jury qui m’ont fait
l’honneur de juger ce travail de thèse.
Je remercie Monsieur Christophe Nguyen-The pour m’avoir accueillie dans son
laboratoire.
Merci à Catherine Duport, ma directrice de recherche, pour m’avoir permis de
faire une thèse sur un sujet aussi enrichissant. Merci de m’avoir donné
l’encadrement nécessaire à ma réussite. Merci aussi de m’avoir transmis ces
nombreux outils scientifiques et merci pour les collaborations que vous avez mis
en place et qui ont été si profitables.
Merci à TOUTE l’équipe de l’UMR A408 …
Merci à Caro, j’aurais aimé t’avoir au labo jusqu’à la fin …
Merci à Véro et Julien pour leurs conseils et gentillesse.
Merci à Mr Yves Jouanneau pour son accueil au CEA, pour son implication dans
mon travail et son aide précieuse pour la purification de cette protéine !
tel-00410526, version 2 - 5 Feb 2010 Remerciements.
Merci à Mr Jean Armengaud pour son aide et les manips réalisées au CEA de
Marcoule.
Merci à l’équipe de l’IUT pour leur accueil. Michel, merci pour tes
encouragements et ton écoute. Tu m’as initié à l’enseignement et je crois
qu’aujourd’hui je suis bien mordue !
Merci à tous les étudiants qui ont été et qui sont de passage, comme moi, dans le
laboratoire. Vous avez tous contribué à un climat de travail amical et agréable.
Un merci particulier à Assia, les 2 Nico, Ouassila, Cam-Cam, béné, Céline,
Charlotte, Stella, Caro et Franck. Plus que des collègues de boulot, certains sont
devenus de véritables amis... À tous, je vous souhaite un futur à la hauteur de
vos attentes.
Merci à ma Carinette (pouet pouet) et Pierrot. Vous m’avez bien pris pour une
folle (et non je ne travaille pas vraiment sur la C…..E !), vous étiez là au tout
début (pour m’héberger !) … maintenant nous y sommes, c’est fini! Merci d’avoir
été là, tout simplement.
Un merci un peu étrange à ma crapette (Aquarel, Crapsou, mon mouchard) dont je
ne comprends toujours pas le langage mais qui par sa présence a apaisé bien de
mes angoisses.
Merci aux habitants du fond du chemin de Castellas ! Merci Jenny pour m’avoir
gardé jusqu’à la fin dans ce petit coin de paradis. Merci à toi Arielle pour ta
gentillesse, tu as été une super voisine et une super nounou pour chat !
Sans oublier,
Lionel. On s'énerve souvent mais finalement je sais que l'on s'aime bien!
Ma Nini, sans toi Vendos ne serait pas si agréable, merci pour ta douceur
et pour tout ce que tu fais pour nous.
À tous ceux que j’ai oubliés ou que je n’ai pu nommer, MERCI!
tel-00410526, version 2 - 5 Feb 2010 Table des matières.
Table des matières
Table des illustrations
Liste des abréviations
Liste des abréviations ____________________________________ 1
Avantpropos _________________________________________ 1
Etude bibliographique ____________________________________ 3
Chapitre 1 : Bacillus cereus _______________________________ 3
1. Bacillus et genres apparentés_______________________________3
2. Le groupe B. cereus ______________________________________4
3. Cycle de vie de B. anthracis, B. cereus et B. thurengiensis _______6
4. Le génome de Bacillus cereus _______________________________8
4.1 Caractères généraux du génome ______________________________8
4.2 Génomique des plasmides du groupe cereus ______________________8
5 Pathologies _____________________________________________9
5.1 Atteintes non gastrointestinales ____________________________ 10
5.2 Atteintes gastrointestinales _______________________________ 10
5.2.1 Définition d’une toxi infection alimentaire ____________________ 10
5.2.2 Toxi infections alimentaires à B. cereus _____________________ 11
5.2.2.1 Caractéristiques ____________________________________ 11
5.2.2.2 Adaptation de Bacillus cereus au tractus digestif___________ 13
5.2.2.2.1 pH et pression en oxygène _________________________ 13
5.2.2.2.2 Potentiel d’oxydoréduction _________________________ 14
5.2.3 Stress oxydant et régulation des gènes______________________ 15
6 Pouvoir pathogène de B. cereus ____________________________ 17
6.1 La toxine émétique _______________________________________ 17
6.2 Les entérotoxines ________________________________________ 18
6.2.1 L’hémolysine BL ________________________________________ 18
6.2.2 L’enterotoxine nonhémolytique ____________________________ 19
6.2.3 La cytotoxine K ________________________________________ 20
6.2.4 L’enterotoxine T et l’enterotoxine FM _______________________ 20
6.3 Autres facteurs de virulence________________________________ 21
Chapitre 2 : Régulation du pouvoir pathogène de Bacillus cereus ______ 21
1. Le regulon PlcR_________________________________________ 21
1.1. PlcR : un activateur transcriptionnel pléiotrope__________________ 21
1.2 Mécanisme d’action de PlcR_________________________________ 22
tel-00410526, version 2 - 5 Feb 2010 Table des matières.
1.3. Bases moléculaires du système PlcRPapR ______________________ 24
1.4. Importance et rôles du régulon PlcR au sein du groupe B. cereus ____ 25
1.5. Les facteurs de virulence échappant au contrôle de PlcR __________ 27
2. Le système à deux composants ResDE _______________________ 27
2.1 Les systèmes de régulation à deux composants: généralités ________ 28