Cinétique enzymatique , livre ebook

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Cet ouvrage est l'unique adaptation française du célèbre Fundamentals of Enzyme Kinetics d'Athel Cornish-Bowden. Il donne une description des principes de base des phénomènes d'inhibition et d'activation, de la régulation allostérique et de la coopérativité. Il aborde les systèmes enzymatiques, le contrôle métabolique et en analyse en détail les applications pratiques.



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Publié par

Date de parution

01 février 2005

Nombre de lectures

4

EAN13

9782759801169

Langue

Français

Poids de l'ouvrage

2 Mo

C OLLECTION G RENOBLE S CIENCES
DIRIGÉE PAR JEAN BORNAREL
CINÉTIQUE
ENZYMATIQUE
Athel CORNISH-BOWDEN
Marc JAMIN
Valdur SAKS
CCINÉTIQUE ENZYMATIQUEGrenoble Sciences
Grenoble Sciences poursuit un triple objectif :
• réaliser des ouvrages correspondant à un projet clairement défini, sans contrainte de
mode ou de programme,
• garantir les qualités scientifique et pédagogique des ouvrages retenus,
• proposer des ouvrages à un prix accessible au public le plus large possible.
Chaque projet est sélectionné au niveau de Grenoble Sciences avec le concours de referees
anonymes. Puis les auteurs travaillent pendant une année (en moyenne) avec les membres
d’un comité de lecture interactif, dont les noms apparaissent au début de l’ouvrage. Celui-ci
est ensuite publié chez l’éditeur le plus adapté.
(Contact : Tél. : (33)4 76 51 46 95 - E-mail : Grenoble.Sciences@ujf-grenoble.fr)
Deux collections existent chez EDP Sciences :
• la Collection Grenoble Sciences, connue pour son originalité de projets et sa qualité
• Grenoble Sciences - Rencontres Scientifiques, collection présentant des thèmes de
recherche d’actualité, traités par des scientifiques de premier plan issus de disciplines
différentes.
Directeur scientifique de Grenoble Sciences
Jean BORNAREL, Professeur à l'Université Joseph Fourier, Grenoble 1
Comité de lecture pour Cinétique enzymatique
Serge CHESNE, Maître de Conférences à l'Université de La Réunion
Jean-Marie FRÈRE, Professeur à l'Université de Liège
Michel VAN DER REST, Professeur à l'Ecole Nationale Supérieure de Lyon,
Directeur-adjoint de la Recherche
et
Julien BRÉVIER
Grenoble Sciences reçoit le soutien du Ministère de l'Éducation nationale,
du Ministère de la Recherche, et de la Région Rhône-Alpes.
Réalisation et mise en pages : Centre technique Grenoble Sciences
Illustration de couverture : Alice GIRAUD
à partir d’une image originale représentant la structure de la créatine kinase fournie par le
Professeur Theo WALLIMANN et le Docteur Uwe SCHLATTNER de ETH de Zurich (Suisse)
ISBN 2-86883-742-5
© EDP Sciences, 2005
©Portland Press, Ltd. London, 2004
This translation of portions of FUNDAMENTALS OF ENZYME KINETICS first
published in (1995, 2004) is published by arrangement with Portland Press, LondonCINÉTIQUE ENZYMATIQUE
Athel CORNISH-BOWDEN
Marc JAMIN
Valdur SAKSOuvrages Grenoble Sciences édités par EDP Sciences
Collection Grenoble Sciences
Chimie. Le minimum à savoir (J. Le Coarer) - Electrochimie des solides (C. Déportes
et al.) - Thermodynamique chimique (M. Oturan & M. Robert) - Chimie organométallique
(D. Astruc) - De l'atome à la réaction chimique (sous la direction de R. Barlet)
Introduction à la mécanique statistique (E. Belorizky & W. Gorecki) - Mécanique statistique.
Exercices et problèmes corrigés (E. Gorecki) - La cavitation. Mécanismes
physiques et aspects industriels (J.P. Franc et al.) - La turbulence (M. Lesieur) -
Magnétisme : I Fondements, II Matériaux et applications (sous la direction d’E. du Trémolet de
Lacheisserie) - Du Soleil à la Terre. Aéronomie et météorologie de l’espace (J. Lilensten &
P.L. Blelly) - Sous les feux du Soleil. Vers une météorologie de l’espace (J. Lilensten &
J. Bornarel) - Mécanique. De la formulation lagrangienne au chaos hamiltonien (C. Gignoux
& B. Silvestre-Brac) - Problèmes corrigés de mécanique et résumés de cours. De Lagrange
à Hamilton (C. Gignoux & B. Silvestre-Brac) - La mécanique quantique. Problèmes résolus,
T. 1 et 2 (V.M. Galitsky, B.M. Karnakov & V.I. Kogan) - Analyse statistique des données
expérimentales (K. Protassov) - Description de la symétrie. Des groupes de symétrie aux
structures fractales (J. Sivardière) - Symétrie et propriétés physiques. Du principe de Curie
aux brisures de symétrie
Exercices corrigés d'analyse, T. 1 et 2 (D. Alibert) - Introduction aux variétés différentielles
(J. Lafontaine) - Analyse numérique et équations différentielles (J.P. Demailly) -
Mathématiques pour les sciences de la vie, de la nature et de la santé (F. & J.P. Bertrandias) -
Approximation hilbertienne. Splines, ondelettes, fractales (M. Attéia & J. Gaches) -
Mathématiques pour l’étudiant scientifique, T. 1 et 2 (Ph.J. Haug)
Bactéries et environnement. Adaptations physiologiques (J. Pelmont) - Enzymes. Catalyseurs
du monde vivant (J. Pelmont) - La plongée sous-marine à l'air. L'adaptation de l'organisme
et ses limites (Ph. Foster) - Endocrinologie et communications cellulaires (S. Idelman &
J. Verdetti) - Eléments de biologie à l'usage d'autres disciplines (P. Tracqui & J. Demongeot
Bioénergétique (B. Guérin)
L'Asie, source de sciences et de techniques (M. Soutif) - La biologie, des origines à nos
jours (P. Vignais) - Naissance de la physique. De la Sicile à la Chine (M. Soutif) - Le régime
oméga 3. Le programme alimentaire pour sauver notre santé (A. Simopoulos, J. Robinson,
M. de Lorgeril & P. Salen) - Gestes et mouvements justes. Guide de l'ergomotricité pour
tous (M. Gendrier)
Listening Comprehension for Scientific English (J. Upjohn) - Speaking Skills in Scientific
English (J. Upjohn, M.H. Fries & D. Amadis) - Minimum Competence in Scientific English
(S. Blattes, V. Jans & J. Upjohn)
Grenoble Sciences - Rencontres Scientifiques
Radiopharmaceutiques. Chimie des radiotraceurs et applications biologiques (sous la
direction de M. Comet & M. Vidal) - Turbulence et déterminisme (sous la direction de M. Lesieur)
Méthodes et techniques de la chimie organique (sous la direction de D. Astruc) - L'énergie
de demain. Techniques, environnement et économie (sous la direction de H. Nifenecker)PRÉFACE
Dans le contexte post-génomique actuel, la recherche en biologie doit faire face à
de nouveaux défis et étendre ses domaines d’investigation vers des niveaux de
complexité croissante. Il s’agit notamment de déterminer la structure et la fonction
de toutes les protéines encodées dans les génomes étudiés, de comprendre les
processus de contrôle de l’expression différentielle de ces protéines dans les
différents types de cellules d’un organisme vivant, de mettre en évidence les
interactions protéine/protéine en relation avec leur implication dans les phénomènes
biologiques (protéomique) ou encore de décrire de manière quantitative le
fonctionnement moléculaire d’un organisme dans ses états normaux et
physiopathologiques. Ce dernier domaine d’étude constitue, dans la mouvance scientifique
actuelle, l’étude du physiome ou physiologie génomique. Cette physiologie
génomique a pour objectif de décrire le fonctionnement des organismes vivants en allant
du génome vers le protéome et le métabolome jusqu’à la caractérisation du
fonctionnement intégré des cellules, des tissus et des organes. Cette étude de systèmes
métaboliques complexes repose sur le développement de modèles compréhensibles
des systèmes biologiques par des méthodes de modélisation mathématique, un
domaine aujourd’hui en plein essor, et sur l’utilisation de la cinétique enzymatique
pour obtenir les données quantitatives nécessaires pour cette analyse. La cinétique
enzymatique a pour objectif d’identifier et de décrire les mécanismes de réaction en
étudiant leur vitesse et les flux métaboliques. En partant des enzymes isolés et en
allant vers des systèmes métaboliques organisés et intégrés, les méthodes de
cinétique enzymatique permettent de décrire de manière quantitative les propriétés
catalytiques des enzymes et les mécanismes de leur régulation.
Historiquement, les lois gouvernant la vitesse des processus chimiques ont été
edécouvertes empiriquement dans le courant du XIX siècle et les explications
théoriques rendant compte des observations phénoménologiques sont apparues au début
edu XX siècle, sur la base des découvertes de la physique moléculaire, de la
thermodynamique chimique et statistique et de la mécanique quantique. La cinétique
enzymatique utilise les théories et les découvertes de la cinétique chimique pour la
description et l’étude des mécanismes des réactions catalysées par des enzymes, les
catalyseurs biologiques, qui sont essentiellement des protéines comportant des sites
actifs catalytiques. Dans les études biochimiques fondamentales, les méthodes
cinétiques sont combinées avec des études structurales et des méthodes de biologie
moléculaire, telle la mutagenèse dirigée, afin d’aboutir à une description du6CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
mécanisme réactionnel au niveau atomique. Ainsi, la cinétique enzymatique est un
outil important et nécessaire dans de nombreuses études biochimiques mais sa
nature quantitative et sa capacité à prévoir l'évolution d’un processus biochimique
au cours du temps, en font également un élément de base de la biotechnologie.
La cinétique enzymatique constitue donc une part importante de la culture et de la
connaissance biochimique que les étudiants en biologie, quelle que soit leur
spécialisation, devraient acquérir au cours de leur cursus. Il existe plusieurs ouvrages
classiques de cinétique enzymatique en anglais (SEGEL, CORNISH-BOWDEN,
GUTFREUND) qui constituent une source de formation et d’information
suffisamment détaillée et complète de ce type d’approche. Toutefois, la situation en langue
française est différente. L’excellent ouvrage de J. PELMONT intitulé Enzymes donne
une bonne description de l’enzymologie, mais principalement de ses aspects
qualitatifs. Le but de notre ouvrage est de fournir un manuel de référence pour la
cinétique enzymatique, complémentaire de celui de PELMONT. Dans ce but, nous
avons traduit et adapté le livre d’Athel CORNISH-BOWDEN intitulé Fundamentals
of Enzyme Kinetics en utilisant le matériel du cours d’enzymologie donné à
l’Université Joseph Fourier de Grenoble par Valdur SAKS et Marc JAMIN. Ce livre
commence par une description des principes simples de la cinétique chimique et de
la thermodynamique et comprend une description détaillée de la cinétique dans des
conditions d’état stationnaire pour les enzymes à un ou à plusieurs substrats, des
phénomènes d’inhibition et d’activation, de la régulation allostérique et de la

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