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Informations
Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 78 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 3 Mo |
Extrait
AVERTISSEMENT
Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le
jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la
communauté universitaire élargie.
Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci
implique une obligation de citation et de référencement lors
de l’utilisation de ce document.
D’autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction
illicite encourt une poursuite pénale.
➢ Contact SCD Nancy 1 : theses.sciences@scd.uhp-nancy.fr
LIENS
Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4
Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10
http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php
http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm École Doctorale RP2E
Université Henri Poincaré Université de Cocody, Abidjan
Faculté des sciences et techniques Faculté des sciences
UFR Sciences et Techniques UFR Sciences de la Terre et des
Matières et Procédés (STMP) Ressources Minières (STRM)
22 BP 582 Abidjan 22
THÈSE en Co-tutelle
Présentée pour l’obtention du grade de
DOCTEUR DE L'UNIVERSITE HENRI POINCARE - NANCY I
en SCIENCE DU SOL Option: Géomicrobiologie
Par
Affi Jeanne BONGOUA DEVISME
Implications des communautés bactériennes ferri-réductrices et des
paramètres environnementaux dans le fonctionnement et la qualité
des sols de rizières (Thaïlande et Côte d’Ivoire)
Soutenue publiquement le 10 Juillet 2009
Membres du Jury:
Rapporteurs : MM. Pierre RENAUD Directeur de Recherche à l’INRA, Avignon, FRANCE
Jean Charles MUNCH Professeur, Technical University of Munich , ALLEMAGNE
Examinateurs: MM. Albert YAO-KOUAME Professeur, Université de Cocody, UFR STRM , CÔTE D’IVOIRE (Co-directeur de thèse)
Roland POSS Directeur de Recherche à l’IRD, Montpellier, FRANCE (Président)
Sitapha DIATTA Chercheur Principal , Centre du riz pour l’Afrique (ADRAO), CÔTE D’IVOIRE (invité)
Christian MUSTIN Chargé de recherche au CNRS-UHP –LIMOS, Nancy 1, FRANCE (Co-directeur de thèse)
Jacques BERTHELIN Directeur de Recherche au CNRS-UHP-LIMOS, Nancy 1, FRANCE ( Directeur de thèse)
Réné Gballou YORO Directeur de recherche au CNRA (LSEP), CÔTE D’IVOIRE (Co-directeur de thèse)
Laboratoire des Intéractions Microorganismes
Minéraux Matières Organiques dans les Sols
Laboratoire central Sols, Eaux, Plantes
UMR 7137, CNRS-UHP Nancy Université,
BP 602 Gagnoa (Côte d’Ivoire)
Faculté des sciences et Techniques, BP 70239
54506 Vandoeuvre -Lès Nancy Cedex (France)
Remerciements
Cette thèse a pu se réaliser grâce à la bourse du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique du
Gouvernement de la République de Côte d’Ivoire. Merci d’avoir rendu possible ce travail.
Tout a commencé à notre arrivée (n’est pas Emile !!) au DEA National de Science du sol à Nancy avec deux mois de retard. Tous les
cours étaient pratiquement achevés. Les responsables du DEA se demandaient s’il fallait nous accepter et participer aux examens ou
attendre une nouvelle année universitaire. A ce niveau, j'exprime toute ma reconnaissance à M. Jacques Berthelin, mon directeur de
thèse, pour avoir insisté auprès de ses collègues afin qu’ils nous acceptent malgré notre retard. Donc merci beaucoup M. Jacques
Berthelin de m’avoir accordé cette chance. Mes remerciements s'adressent aussi à mon co-directeur de thèse, Christian Mustin qui
m’apprit l’essentiel sur la microbiologie dont je n’avais aucune notion à mon arrivée. Merci à vous deux de m’avoir fait confiance en me
proposant cette thèse et de l’aide que vous m’avez apporté pendant tout ce travail.
Ma reconnaissance va aussi aux présidents des Universités de Cocody Abidjan-Côte d’Ivoire et de l’Université Henri Poincaré de Nancy
I, pour avoir ratifié la convention de co-tutelle, au Professeur BIEMI Jean, Doyen de l’UFR STRM, pour m’avoir permis d’effectuer la
thèse en co-tutelle à l’UFR STRM, à Feu Professeur Pothin Kablan et à l’ensemble des enseignants qui m’ont encadrée en me gratifiant
d’une formation de qualité tout au long de mon cursus universitaire.
Ma très grande gratitude va à feu professeur ASSA Ayémou, Directeur de ma thèse à l’Université de Cocody, de m’avoir recommandé
pour ce DEA, puis d’avoir été l’un des artisans de la co-tutelle mais qui, malheureusement, nous a quittés quelques mois avant de voir ce
travail achevé. Son amour pour la pédologie m’a poussée, dès la première année à l’Université, à m’orienter dans cette voie. Que la terre
lui soit légère. Mes remerciements s’adressent aussi à M. Albert Yao-Kouamé qui lui a succédé en tant que professeur et co-directeur de
cette thèse.
Je remercie également, Corinne Leyval, directrice du LIMOS, pour m’avoir très gentiment accueillie au sein de son laboratoire et mis à
ma disposition les équipements ainsi que les compétences de son équipe.
J’adresse mes remerciements au Directeur Général du CNRA, Dr YO Tiémoko, pour avoir accepté le projet de convention entre le CNRA
et LIMOS-CNRS, qui m’a permis de réaliser une partie de mes travaux au sein de la structure qu’il dirige.
Je remercie aussi très sincèrement et chaleureusement Dr YORO Gballou René, Directeur du Laboratoire Central Sols, Eaux, Plantes du
CNRA à Gagnoa, d'avoir codirigé cette thèse. Il a toujours su être un maître du conseil, d'une grande disponibilité lors de la réalisation
de mes travaux de terrain à Gagnoa, en Côte d’Ivoire.
i
Je suis très honorée que les professeurs Jean Charles Munch et Pierre Renault, aient accepté de juger ce travail en tant que rapporteurs.
Je tiens également à remercier M. Roland Poss d’avoir accepté de faire partie de ce jury de thèse et d’y représenter l’IRD malgré son
temps déjà très occupé. Je suis particulièrement reconnaissante à M. Sitapha Diatta pour ses nombreuses et pertinentes remarques, et
pour sa disponibilité malgré l’éloignement. J'en profite aussi pour vous exprimer toute ma gratitude.
Mes remerciements vont aussi au Directeur des programmes d’Appui au Développement du CNRA, Dr ADIKO Amoncho, qui a été d’un
appui important pour la réalisation de la thèse en co-tutelle. Je remercie également Emmanuel Kassin grâce à qui la mission à Gagnoa a
été une réussite. Je suis également redevable envers Aurélie Cébron dont les compétences en biologie moléculaire et l’anglais savant ont
été une aide précieuse au travers de tous ces articles et expériences. Tu m’as permis de découvrir et de comprendre la "biomol". Je
tiens également à remercier vivement Dr. KELI Zagbahi Jules, Directeur de recherche et Directeur régional du CNRA de Man, pour ses
conseils.
J’adresse mes sincères remerciements à toute l’équipe de l’IRD et à celle de Land Department and Development (Bangkok) dans le
cadre du projet TICA (Thailand International Cooperation Agency) qui ont effectué la plupart des mesures et les prélèvements des
échantillons de sol de Thaïlande.
Je rends hommage à toutes les personnes qui m’ont aidé, de près ou de loin, pour la prise des mesures et la mise en œuvre de mes
expériences : Jojo, Christine, David, Hervé, Géraldine, Nadim, Emmanuelle Montarges ainsi que Jafar (pour la magie de l'infiniment
petit). Un coucou à mon seul frère de Nancy, Emile Bolou Bi, reste toujours serviable et beaucoup de courage dans ta rédaction de thèse.
Au cours de ces 5 années, je n’oublierai jamais ma deuxième famille, celle du « labo », avec laquelle j’ai partagé les bons comme les
mauvais moments : Chanchan (pour sa gentillesse), Thierry ( et ses blagues), Jojo, Christine, Colette (merci pour tes corrections et tes
remarques constructives apportées). Un grand merci à tous mes collègues de travail devenus des amis : Zaz, Paul olivier, Arsène, Emile,
Clarisse, Brice, Elsa, Goshia, Cecile, Babou. J’ai vécu de bons moments au sein du LIMOS, grâce à tous ceux déjà cités et bien d’autres :
Anne, Patrik, Sylvie Dousset, Dominique, Sylvie Desobry, Jean Pierre, Fabien, …. je garderai des souvenirs inoubliables de cette
époque.
Je n'oublie pas non plus mes sœurs et frères : Alika, Mado, Léa, Janine, Marc, Yolande, Chantal ainsi que ma belle-mère Assoh Marie
que je remercie infiniment