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Publié par	Irgu
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Langue	English

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The NetCDF Tutorial
NetCDF the Easy Way Version 4.1.3
Last Updated 10 June 2011
Ed Hartnett
Unidata Program CenterCopyright c 2005-2009 University Corporation for Atmospheric Research
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Table of Contents
1 What is NetCDF? : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 1
1.1 The Classic NetCDF Data Model: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 1
1.1.1 Meteorological Example : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 1
1.2 The Common Data Model and NetCDF-4 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 2
1.3 NetCDF Error Handling: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 3
1.4 Unlimited Dimensions : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 3
1.5 Fill Values : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 4
1.6 Tools for Manipulating NetCDF Files: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 4
1.7 The NetCDF Programming APIs : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 5
1.8 NetCDF Documentation : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 6
1.9 A Note on NetCDF Versions and Formats : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 6
1.9.1 Classic Format : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 7
1.9.2 64-bit Offset Format: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 7
1.9.3 NetCDF-4/HDF5 Format: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 7
1.9.4 Sharing Data : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 7
1.9.5 Classic Model : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 8
2 Example Programs : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 9
2.1 The simple xy Example : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 9
2.1.1 xy wr.c and simple xy rd.c : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 10
2.1.1.1 simple xy wr.c : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 10
2.1.1.2 xy rd.c: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 12
2.1.2 simple xy wr.f and simple xy rd.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 14
2.1.2.1 simple xy wr.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 14
2.1.2.2 xy rd.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 16
2.1.3 simple xy wr.f90 and simple xy rd.f90: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 18
2.1.3.1 simple xy wr.f90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 18
2.1.3.2 xy rd.f90: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 20
2.1.4 simple xy wr.cpp and simple xy rd.cpp : : : : : : : : : : : : : : : : : : 22
2.1.4.1 simple xy wr.cpp: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 22
2.1.4.2 xy rd.cpp : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 23
2.2 The sfc pres temp Example : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 25
2.2.1 sfc pres temp wr.c and sfc pres temp rd.c: : : : : : : : : : : : : : : : 26
2.2.1.1 sfc pres temp wr.c : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 26
2.2.1.2 sfc pres temp rd.c: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 30
2.2.2 sfc pres temp wr.f and sfc pres temp rd.f : : : : : : : : : : : : : : : : 34
2.2.2.1 sfc pres temp wr.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 34
2.2.2.2 sfc pres temp rd.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 38
2.2.3 sfc pres temp wr.f90 and sfc pres temp rd.f90: : : : : : : : : : : : 42
2.2.3.1 sfc pres temp wr.f90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 42
2.2.3.2 sfc pres temp rd.f90: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 45
2.2.4 sfc pres temp wr.cpp and sfc pres temp rd.cpp: : : : : : : : : : : 48
2.2.4.1 sfc pres temp wr.cpp: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 48ii The NetCDF Tutorial
2.2.4.2 sfc pres temp rd.cpp : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 51
2.3 The pres temp 4D Example : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 55
2.3.1 pres temp 4D wr.c and pres temp 4D rd.c : : : : : : : : : : : : : : : 57
2.3.1.1 pres temp 4D wr.c : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 57
2.3.1.2 pres temp 4D rd.c : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 61
2.3.2 pres temp 4D wr.f and pres temp 4D rd.f: : : : : : : : : : : : : : : : 65
2.3.2.1 pres temp 4D wr.f : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 65
2.3.2.2 pres temp 4D rd.f: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 70
2.3.3 pres temp 4D wr.f90 and pres temp 4D rd.f90 : : : : : : : : : : : 73
2.3.3.1 pres temp 4D wr.f90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 73
2.3.3.2 pres temp 4D rd.f90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 77
2.3.4 pres temp 4D wr.cpp and pres temp 4D rd.cpp : : : : : : : : : : 80
2.3.4.1 pres temp 4D wr.cpp : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 80
2.3.4.2 pres temp 4D rd.cpp : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 84
3 The Functions You Need in NetCDF-3 : : : : : : 87
3.1 Creating New Files and Metadata, an Overview : : : : : : : : : : : : : : : 87
3.1.1 Creating a NetCDF File in C : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 87
3.1.2 a File in Fortran 77 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 88
3.1.3 Creating a NetCDF File in F 90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 88
3.1.4 a File in C++ : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 89
3.2 Reading NetCDF Files of Known Structure : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 90
3.2.1 Numbering of NetCDF IDs : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 90
3.2.2 Reading a Known NetCDF File in C: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 90
3.2.3 a Known File in Fortran 77 : : : : : : : : : : : : : 91
3.2.4 Reading a Known NetCDF File in F 90 : : : : : : : : : : : : : 91
3.2.5 a Known File in C++ : : : : : : : : : : : : : : : : : : 91
3.3 Reading NetCDF Files of Unknown Structure : : : : : : : : : : : : : : : : : 92
3.3.1 Inquiry in C: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 92
3.3.1.1 NULL Parameters in Inquiry Functions : : : : : : : : : : : : : : 93
3.3.2 Inquiry in Fortran 77 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 94
3.3.3 in F 90 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 95
3.3.4 Inquiry Functions in the C++ API : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 96
3.4 Reading and Writing Subsets of Data: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 97
3.4.1 Reading and Writing Subsets of Data in C : : : : : : : : : : : : : : : : 97
3.4.2 and Writing of Data in Fortran 77 : : : : : : : 98
3.4.3 Reading and Writing Subsets of Data in F 90 : : : : : : 100
3.4.4 and Writing of Data in C++ : : : : : : : : : : : 101iii
4 API Extensions Introduced with NetCDF-4
: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 103
4.1 Interoperability with HDF5 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 103
4.1.1 Reading and Editing NetCDF-4 Files with HDF5 : : : : : : : : 103
4.1.2 and HDF5 Files with NetCDF-4 : : : : : : : : 103
4.2 Multiple Unlimited Dimensions: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.3 Groups : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.4 Compound Types : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.5 Opaque Types : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.6 Variable Length Arrays (VLEN) : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.7 Strings: : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 104
4.8 New Inquiry