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profil-zyak-2012 - Claire - Emmanuelle Marcato

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Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
N° d'ordre : 2515 THESE présentée pour obtenir LE TITRE DE DOCTEUR DE L'INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE TOULOUSE École doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques et Bioingénieries Spécialité : Fonctionnement des Ecosystèmes et Agrosystèmes Par Melle Claire-Emmanuelle MARCATO ORIGINE, DEVENIR ET IMPACT DU CUIVRE ET DU ZINC DES LISIERS PORCINS. ROLE DE LA DIGESTION ANAEROBIE Soutenue le 5 octobre 2007 devant le jury composé de : M. Nicolas BERNET Directeur de recherche INRA Rapporteur M. Philippe HINSINGER Directeur de recherche INRA Rapporteur M. Jean-Claude REVEL Professeur, INPT-ENSAT Président M. Eric PINELLI Professeur, INPT-ENSAT Membre M. Jean-Louis CRABOS Directeur adjoint, APESA Membre Mme Sylvie COTELLE Maître de conférences, Université de Metz Membre Mme Maritxu GUIRESSE Maître de conférences, INPT-ENSAT Directrice de thèse

voyage initiatique sans compagnons de route

inpt-ensat directrice de thèse

impact du cuivre et du zinc des lisiers porcins

heures sur le microscope

Sujets

Institut national polytechnique de Toulouse

Blandine

Bernet

Nicolas

René Crabos

Université Paul-Verlaine - Metz

Pinelli

Marcato

Informations

Publié par	profil-zyak-2012
Publié le	01 octobre 2007
Nombre de lectures	140
Langue	Français
Poids de l'ouvrage	2 Mo

Extrait

N° d’ordre : 2515

THESE

présentée

pour obtenir

LE TITRE DE DOCTEUR DE L’INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE TOULOUSE

École doctorale : Sciences Ecologiques Vétérinaires Agronomiques et Bioingénieries

Spécialité : Fonctionnement des Ecosystèmes et Agrosystèmes

Par Melle Claire-Emmanuelle MARCATO

ORIGINE, DEVENIR ET IMPACT DU CUIVRE ET DU ZINC DES LISIERS PORCINS.
ROLE DE LA DIGESTION ANAEROBIE

Soutenue le 5 octobre 2007 devant le jury composé de :

M. Nicolas BERNET Directeur de recherche INRA Rapporteur
M. Philippe HINSINGER Directeur de recherche INRA Rapporteur

M. Jean-Claude REVEL Professeur, INPT-ENSAT Président
M. Eric PINELLI Professeur, INPT-ENSAT Membre
M. Jean-Louis CRABOS Directeur adjoint, APESA Membre
Mme Sylvie COTELLE Maître de conférences, Université de Membre
Metz
Mme Maritxu GUIRESSE Maître de conférences, INPT-ENSAT Directrice de thèse

Remerciements

REMERCIEMENTS

Je me dois de remercier tout d’abord les organismes qui ont participé à la production de cette
épopée des temps modernes : l’ANRT, l’ADÆSO puis l’APESA, l’ADEME et l’INPT.
Mais ce travail ayant été une telle aventure humaine, ne m’en veuillez pas de plutôt faire la
part belle à ses protagonistes…
Il n’existe pas d’aventure sans aventurier. Et pas d’aventurier sans parents. Merci donc à vous
deux pour avoir été présents du commencement à l’aboutissement de toutes mes entreprises, et y
compris de celle-ci.
De plus, pour faire un bon conte fantastique, il convient d’avoir, outre des parents aimants,
une méchante sorcière. Et pour faire face à cette dernière, que peut-il y avoir de mieux que 3 bonnes
fées ? Maritxu, Philippe et Eric, je tiens à vous remercier le plus sincèrement pour l’attention et
l’accompagnement qui ont été les vôtres et qui ont permis d’atténuer le mauvais sort.
Et que serait un voyage initiatique sans compagnons de route ?
Un très très très grand merci à mon Kéké et à Perrine grâce auxquels j’ai pu développer ma
culture télévisuelle et cosmétique, ainsi que prendre un peu de repos pour mieux me relancer dans
ma quête. Je ne sais pas comment je vous rendrai la pareille, mais mon amitié vous sera aussi fidèle
que vos canapés ont été confortables !
Un tout aussi grand merci à Marie et à Geoff, pour leurs coups de pouce, leur patience, leur
compréhension, leur présence, leur clic-clac, et tout le reste… Promis, je vous ferai autant de
relectures que vous voudrez !!! Mais n’oubliez pas vos vitamines ! Et pardon Geoff pour Calicéo…
Une pensée également pour tous les occupants des doctotrons, et en particulier Tom, Aurore,
Tim et Bouze, et un clin d’œil à Alain pour les heures passées à l’ICP…
Et je m’en voudrais d’oublier ces « petites mains » qui ont travaillé dans l’ombre (c’est la cas
de le dire pour ceux qui ont passé des heures sur le microscope)… Merci donc aux différents
stagiaires : Sandrine, Leslie, Véro, Alex, Cassien, Warren, Elisa (dans l’ordre d’apparition). Merci
également à Eric et Blandine, techniciens de l’APESA, pour leur collaboration et leur autonomie sans
lesquelles il aurait été impossible de mener à bien les différents projets.
Et puis, parmi les compagnons de route, il y a ceux de sang. Fred et Juju, je n’ai jamais pris le
temps de vous dire merci pour votre présence fraternelle dans les bons (« on est là pour s’amuser, on
est là pour s’amuser… ») et les moins bons moments (merci vraiment), alors voilà chose faite. Il y a
également ceux qui, malheureusement, ne verront pas le bout du chemin. J’ai une pensée particulière
pour tous ces collègues de la première heure, en espérant que leur reconversion forcée a été, est et
sera une source de nouveaux épanouissements professionnels. Remerciements

Et bien sûr, dans toute aventure fantastique, il y a des elfes, dont le rôle peut sembler mineur,
mais qui vous donnent le coup de pouce qui va bien, vous tirent d’un mauvais pas et vous remettent
sur le sentier de votre graal. Merci donc à l’ensemble des membres du labo et à ceux de ma famille, à
ème
Jérôme (SAMU), à Bruno et Claude (SOS-détresse-amitié !), à Amine, mon 3 frère, à Annette et
son service statistique, à Laurette et ses équilibres acide-base, à Mag pour nos goûters du dimanche
et tout le reste, et à tous les copains de Toulouse, de Pau et d’ailleurs, trop nombreux pour les citer !
Il est bien entendu impossible d’oublier les ancêtres... A-t-on jamais vu une telle expédition
sans un vieux sage qui traîne pour vous prodiguer les riches enseignements de sa longue vie ? Merci
donc à mes grands-parents, connus et inconnus, arrachés à leur terre natale et dont le travail et la
volonté ont été le salut. A ces valeurs qu’ils nous ont transmises et sans lesquelles j’aurais jeté dix fois
l’éponge.
Enfin, à quoi bon une telle quête si elle ne conduit pas à l’amour ? Merci Nanou de m’aider à
écrire les dernières pages pour que nous puissions clore l’histoire par le traditionnel « ils vécurent
heureux et eurent beaucoup d’enfants »…
Avant-propos

AVANT-PROPOS

Ce doctorat a été réalisé entre milieu professionnel et milieu académique dans le cadre d’une
convention CIFRE. Cette dualité m’a permis de poursuivre mon parcours professionnel d’ingénieur,
entamé dès 2001 en bureau d’études, tout en complétant ma formation scientifique et de recherche.
De plus, le projet a été marqué par différents évènements de la vie d’une entreprise ou d’un
laboratoire, avec leur lot d’enseignements humains. Ainsi, dès la deuxième année, l’ADÆSO
(Association pour le Développement Agro-Environnemental du Sud-Ouest), premier partenaire
industriel, dont les activités principales étaient l’expérimentation en élevage porcin et pour le
traitement des déchets organiques a dû arrêter ses activités. Une cession de branche d’activité a alors
été opérée pour les prestations relatives au traitement de la matière organique. L’APESA (Association
Pour la Sécurité et l’Environnement en Aquitaine) ayant repris ces activités, elle est devenue le
partenaire industriel d’une seconde convention CIFRE, avec une priorité donnée à la pollution des
sols et à la bioindication, modifiant ainsi les orientations du projet. Puis, au cours de la troisième
année, le laboratoire AEE (Agronomie Environnement Ecotoxicologie) de l’ENSAT (Ecole Nationale
Supérieure Agronomique de Toulouse) a fusionné avec les laboratoires LEH (Laboratoire d'Ecologie
des Hydrosystèmes) et LadyBio (LAboratoire Dynamique de la BIOdiversité) de l’UPS (Université Paul
Sabatier, Toulouse), ainsi qu’avec une partie du LMTG (Laboratoire des Mécanismes et Transferts en
Géologie) pour devenir l’unité mixte de recherche ECOLAB, laboratoire d’écologie fonctionnelle (UMR
5245 CNRS/UPS/INPT ENSAT). Enfin, le doctorat s’est déroulé entre deux régions, Aquitaine et
MidiPyrénées, se traduisant par un excellent apprentissage du travail à distance, relativement aisé pour
les opérations pratiquées en routine dans chacun des laboratoires, mais très délicat pour les
expérimentations innovantes pour l’une ou l’autre des équipes.
Ce projet a permis de constituer un véritable pont entre les différentes structures. Les thèmes
développés par une partie, tels que la méthanisation et le traitement biologique des déchets
organiques (ADÆSO), la gestion des sols pollués (APESA), l’écotoxicologie (AEE) ou encore
l’agronomie et le retour au sol des déchets organiques (ADÆSO, AEE), ont pu être valorisés
mutuellement.
Ainsi, l’expérience de l’ADÆSO en terme d’élevage porcin et