Mémento technique à l’usage des biologistes et biochimistes , livre ebook

Abderrazak Marouf et Gérard Tremblin
Mémento technique à l usage des biologistes et biochimistes
Copyright

© EDP Sciences, Les Ulis, 2013
ISBN papier : 9782759809653 ISBN numérique : 9782759829873
Composition numérique : 2023
http://publications.edpsciences.org/
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Présentation

L’ouvrage (livre + site web ) répond aux questions que se posent ceux qui pratiquent concrètement la chimie du vivant. Les deux premières parties présentent sous forme de glossaire les concepts et les termes techniques d’une part, les appareils et instruments utilisés d’autre part. La troisième partie est une véritable banque de recettes pour l’utilisation des réactifs utilisés lors d’analyses.
En outre, les annexes de l’ouvrage et le site web associé (en libre accès) complètent ce « couteau suisse » de l’expérimentateur : unités utilisées dans les appareillages, bibliographie, synonymes et acronymes français et anglais des produits chimiques, caractéristiques des corps chimiques utilisés, utilisations courantes et dangerosité… Bien sûr, la couverture a été réalisée pour résister à quelques produits corrosifs…
Le public, large, est celui des expérimentateurs en chimie du vivant : les techniciens et ingénieurs de la recherche et de l’entreprise, les étudiants des divers niveaux (BTS, IUT, Licence, Master de biochimie et biotechnologie, thésards), les enseignants, les chercheurs…
Table des matières Avant-propos Remerciements Partie 1. Concepts 1. Concepts A B C D E F G H I J,K L M N O P Q R S T U V W X Y Z 2. Appareils et instruments 2. Appareils et instruments A B C Colonnes et solvants Injecteurs Systèmes de pompage Détecteurs Injecteur : Colonne : Phases stationnaires : Le four : La phase mobile ou gaz vecteur : Le détecteur : D E F G H I J-K L M N O P Q-R S T U-V 3. Formulaire des produits et des réactifs de laboratoire 3. Formulaire des produits et des réactifs de laboratoire A B C D E F G H I J K L M N O P R S T U V W Z Annexe 1. Unités, symboles et conversion Annexe 2. Lexique Anglais-Français Bibliographie Sommaire Webographie
Avant-propos

C e mémento est destiné dans un premier temps à des praticiens de laboratoire, techniciens, ingénieurs, étudiants débutant un travail de thèse et découvrant la paillasse, chercheur confirmé à l interface de la biologie et de la chimie, technicien en formation (BTS et DUT) etc. Il a l ambition de répondre à la plupart des questions que ces derniers peuvent se poser lors de leurs activités journalières dans le laboratoire mais aussi tout au long de leur carrière. Il est volontairement découpé en trois parties thématiques reprenant à chaque fois l ordre alphabétique pour une plus grande facilité d utilisation : le glossaire des concepts généraux, le glossaire de l appareillage et des équipements de laboratoire, le formulaire des réactifs, leur recettes et leur protocole d utilisation ; et en annexe un glossaire des unités couramment utilisées au laboratoire et un lexique anglais-français. Un formulaire chimique des molécules organiques citées dans l ouvrage ainsi qu un formulaire « sécurité » sur les risques chimiques pour la santé et l environnement lors de leur utilisation est en ligne sur le site web corrélé à cet ouvrage :

La première partie non exhaustive traite d un ensemble de concepts et de vocabulaire techniques propres à l association de ces deux spécialités que sont la biologie au sens large et la chimie dans ses applications au vivant : expressions et locutions spécifiques clairement définies, compléments étymologiques, exemples dans le contexte encyclopédique, synonymes et antonymes, ou encore expressions formées à partir du terme défini, renvois et corrélats entre les divers articles (en gras ), traduction anglaise et illustrations.
La seconde partie apporte des notions de bases sur l instrumentation des laboratoires, c est-à-dire le minimum à connaître lorsque l on veut utiliser un appareil ou une technique.
La troisième partie concerne les recettes souvent oubliées ou perdues des très nombreux réactifs indispensables lors de la mise en place de protocoles d études et d analyses. Cette partie devrait permettre à l utilisateur de retrouver rapidement la composition et les conseils de préparation des innombrables solutions qu il est nécessaire de préparer avant toute manipulation. Pour chaque produit ou réactif sont donnés succinctement son ou ses utilisations courantes, son mode de préparation, son mode d utilisation et les résultats à obtenir, et quand cela est possible, sa durée et ses conditions de conservation.
Une partie annexe traite des unités liées aux appareils les plus utilisés dans les laboratoires de chimie, de biochimie et de biologie.
Volontairement, les réactifs et milieux propres à la microbiologie ont été écartés dans la mesure où on les trouve facilement dans de nombreux ouvrages spécialisés.
Les formules des corps chimiques cités dans le texte sont données entre parenthèse lorsqu ils sont de nature minérale, et mis à disposition sur le site web corrélé (formule brute et développée, masse molaire, présence ou non d isomères et aspect physique, risques lors de leur utilisation et consignes de sécurité, utilisation courante) lorsqu ils sont de nature organiques.
Conçu comme un ouvrage clair et maniable, ce mémento explicatif aidera son utilisateur, initié ou non, à lever les incertitudes sur la signification d expressions techniques ou d abréviations des différents domaines concernés. Ce mémento devrait être le couteau suisse du biologiste confronté on live à une expérience ou à une analyse.
La place de cet ouvrage est donc directement dans le laboratoire, en contact avec la paillasse, aussi sa couverture est-elle conçue pour résister aux produits agressifs qu il risque de rencontrer. Après quelques mois d utilisation, il risque d être couvert de taches, brulé par les acides ou par d autres réactifs mais toujours disponible (sous la main du chercheur ou du technicien). Sa présentation sous forme de plusieurs glossaires a pour but de faciliter la recherche du terme, de la technique ou du réactif le tout dans un ouvrage unique évitant ainsi toute perte de temps. Comme ce livre restera toujours non exhaustif et afin de lui permettre d évoluer quelques pages sont restées vierges et permettent à l utilisateur de compiler ses propres données.
Cet ouvrage est en premier lieu destiné aux acteurs des laboratoires de recherche privés comme publics en sciences du vivant (biologie/biochimie/biotechnologie/biologie moléculaire/génétique, etc.) mais aussi aux techniciens préparant les enseignements pratiques en sciences de la vie à tous les niveaux de la scolarité aussi bien dans l enseignement secondaire que dans l enseignement supérieur. Les chimistes qui travaillent de plus en plus sur des modèles biologiques devraient aussi pouvoir y trouver leur compte.
On pourrait nous opposer qu il existe sur internet de nombreux moteurs de recherche qui permettent d obtenir des informations similaires, toutefois d une part l ordinateur n est pas toujours à disposition sur la paillasse et surtout l information scientifique diffusée est le plus souvent de qualité inégale voire erronée bien qu elle tende à s améliorer. Et surtout, elle n a pas été expertisée ni validée par des scientifiques reconnus et compétents alors que cet ouvrage a la caution scientifique à la fois des auteurs et des experts de Grenoble Sciences . Enfin, le livre papier reste à notre avis le support le plus accessible ne nécessitant pas de niveau de compétence spécifique, disponible en tout lieu et transmissible.
Remerciements

L es auteurs remercient les treize correcteurs anonymes de Grenoble Sciences qui grâce à leurs remarques pertinentes et constructives ont permis de fortement améliorer le contenu de cet ouvrage.
Les auteurs remercient aussi les cinq membres du comité de lecture avec lesquels nous avons eu des échanges fructueux et qui ont pris sur leur temps de travail pour lire les quelques 850 pages du document présenté. Ils ont mis gracieusement l ensemble de leurs compétences à notre disposition afin de valider les nombreuses rubriques de l ouvrage.
Abderrazak Marouf est particulièrement redevable à messieurs K. Cheriti et N. Belboukhari, respectivement professeur et maître de conférences à l université de Béchar, qui ont très aimablement accepté de revoir certaines parties relevant de leurs compétences. La préparation de cet ouvrage aura été impossible sans les multiples formes d aide dont j ai bénéficiées de mon épouse à laquelle je dédie ce travail ainsi qu à mes quatre enfants pour leur compréhension, leur encouragement et leur patience tout au long de la préparation du manuscrit.
Gérard Tremblin remercie tout particulièrement ses collègues de l équipe MMS (Mer, Molécules, Santé) et en particulier Sophie Hiard et Brigitte Moreau dont les connaissances et les compétences techniques ont permis d enrichir cet ouvrage sans oublier ma collègue Aurore Caruso, Maître de conférence au laboratoire, qui a accepté de prendre un peu de temps sur ses loisirs pour revoir tout ce qui était de ses compétences en Biologie Moléculaire. Je remercie aussi mes collègues proches les Professeurs Annick Morand-Monceau avec qui je collabore à tous les niveaux depuis plus de 25 ans et Benoit Schoefs, plus récemment arrivé dans l équipe, qui m ont toujours encouragé. Enfin, je tiens particulièrement à remercier mes collègues chimistes (Madame Sagrario Pascual et Messieurs Laurent Fontaine, Gilles Dujardin et Pasca