The selective and demographic history of Drosophila melanogaster [Elektronische Ressource] / Lino Ometto

Dissertation zur Erlangung des Doktorgradesder Naturwissenschaften an der Fakultät für Biologieder Ludwig-Maximilians-Universität München The selective and demographic history of Drosophila melanogasterLino OmettoausVicenza, Italien2006ErklärungDiese Dissertation wurde im Sinne von §13 Abs. 3 bzw. 4 der Promotionsordnung von Prof. Dr. Wolfgang Stephan betreut. Ehrenwörtliche Versicherung Diese Dissertation wurde selbstständig, ohne unerlaubte Hilfe erarbeitet.1. Gutachter: Prof. Dr. Wolfgang Stephan 2. Gutachter: Prof. Dr. John ParschDissertation eingereicht am: 16.12.2005Tag der mündliche Prüfung: 17.02.2006a elisa, mareTable of ContentsSummary 1Note 3Introduction 5List of abbreviations 111. A survey of DNA variation in the X chromosome of Drosophila melanogaster 131.1. The impact of demography and natural selection on the genetic variation of Drosophila melanogaster 151.1.1. Materials and Methods 151.1.1.1. Population samples 151.1.1.2. PCR amplification and DNA sequencing 161.1.1.3. Statistical analysis 161.1.1.4. Recombination rate 171.1.1.5. Demographic modeling of the European population 171.1.2. results 181.1.2.1. Polymorphism patterns in the African population 191.1.2.2. Polymorphism patterns in the European population 231.1.2.3. Comparison of the African and European populations 271.1.3. discussion 271.1.3.1.