Systems biology analysis of iron metabolism [Elektronische Ressource] / Tiago Jose da Silva Lopes. Gutachter: Edda Klipp ; Martina Muckenthaler ; Hermann-Georg Holzhutter

Systems biology analysis of iron metabolism D i s s e r t a t i o n zur Erlangung des akademischen Grades d o c t o r r e r u m n a t u r a l i u m ( Dr. rer. nat.) im Fach Biophysik eingereicht an der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät I der Humboldt-Universität zu Berlin von Herrn Tiago Jose da Silva Lopes Präsident der Humboldt-Universität zu Berlin Prof. Dr. Dr. h.c. Christoph Markschies Dekan der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät I Prof. Dr. Andreas Herrmann Gutachter: 1. Prof. Edda Klipp 2. Prof. Martina Muckenthaler 3Prof. Hermann-Georg Holzhutter Tag der mündlichen Prüfung: 05.December.2010 For my family. For my friends from the past, present and future. Contents 1 - Introduction.............................................................................................. 1 2 - Models and Experimental Methods ........................................................ 5 2.1 General Structure of Iron Metabolism .............................................................5 2.2 General Flux Network of Iron in the Organism...............................................5 2.3 Iron balance: absorption from duodenum and loss from the body ..................7 2.4 Numerical Scales of Pools and Turnover Rates. ..............................................7 2.4.1 Scaling of iron content to the whole mouse organism.................................