Single molecule fluorescence detection in nanoscale confinement [Elektronische Ressource] / von Johannes Hohlbein

Single Molecule Fluorescence Detectionin Nanoscale ConfinementDissertationzur Erlangung des akademischen GradesDoctor rerum naturalium (Dr. rer. nat.)vorgelegt derMathematisch-Naturwissenschaftlich-Technischen Fakultät(mathematisch-naturwissenschaftlicher Bereich)der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenbergvon Herrn Johannes Hohlbeingeb.: 20. 05. 1980 in: Wippra, DeutschlandGutachter:1. Prof. Dr. U. Gösele2. Prof. Dr. C. Hübner3. Prof. Dr. J. LuptonHalle (Saale), am 31. 03. 2008urn:nbn:de:gbv:3-000013420[http://nbn-resolving.de/urn/resolver.pl?urn=nbn%3Ade%3Agbv%3A3-000013420]iiContentsNomenclature 11 Introduction 22 Single molecule spectroscopy: fundamentals and beyond 52.1 The photophysics of single molecules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52.2 Single molecule detection in solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72.3 Scanning confocal optical microscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82.4 Single pair fluorescence resonance energy transfer . . . . . . . . . . . . . . . . 102.5 Fluorescence correlation spectroscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142.6 Orientation determination: from 2-D to 3-D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 182.7 Geometrical confinement of diffusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203 Materials and methods 223.1 Self-ordered porous alumina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223.2 The scanning confocal optical microscopy set-up . . . . .