Regulation of anaerobic catabolism of aromatic compounds and sulfate reduction in Desulfobacula toluolica Tol2 [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Jacob H. Jacob

Regulation of anaerobic catabolism of aromatic compoundsand sulfate reduction in Desulfobacula toluolica Tol2 Dissertation zur Erlangung des Grades eines Doktors der Naturwissenschaften - Dr. rer. nat. - dem Fachbereich Biologie/Chemie der Universität Bremen vorgelegt von Jacob H. Jacob Bremen2007 Die Untersuchungen zur vorliegenden Doktorarbeit wurden am Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologie in Bremen durchgeführt. 1. Gutachter: Prof. Dr. Friedrich Widdel 2. Gutachter: Prof. Dr. Ralf Rabus Tag des Promotionskolloquiums: 20, September 2007To my family ContentsSummaryAbbreviationsPageTitleA Introduction 1. Aromatic compounds 1.1. Definition, chemical properties and classification 1 1.2 Sources 2 .3 Txicty 2. Aerobic catabolism of aromatic compounds 3 3. Anaerobic catabolism of aromatic compounds 3.1. Microorganisms 4 3.2. Degradation pathways 6 4. Dissimilatory sulfate reduction 8 5. Desulfobacula toluolica Tol2 10 6. Aims of study 11 B Materials and methods 1. Chemicals, gases and source of bacterium 12 2. Cultivation techniques 2.1. Medium composition and preparation 2.1.1. Preparation of stock solutions 12 2.1.2. Preparation of mineral medium 15 2.1.3. Organic substrates and electron acceptors 16 2.2. Cultivation 2.2.1.