Population genetic approaches to speciation of wild tomatoes with special reference to Solanum habrochaites and S. arcanum [Elektronische Ressource] / Carlos Gonzalo Merino Méndez

Population Genetic Approaches to Speciation of Wild Tomatoes with Special Reference to Solanum habrochaites and S. arcanum Dissertation der Fakultät für Biologie der Ludwig-Maximilians-Universität München Carlos Gonzalo Merino Méndez Aus Lima ERKLÄRUNG Diese Dissertation wurde im Sinne von §12 der Promotionsordnung von Herrn Professor Dr. Wolfgang Stephan betreut. Ich erkläre hiermit, dass die Dissertation nicht einer anderen Prüfungskommission vorgelegt worden ist und dass ich mich nicht anderweitig einer Doktorprüfung ohne Erfolg unterzogen habe. EHRENWÖRTLICHE VERSICHERUNG Ich versichere hiermit ehrenwörtlich, dass die vorgelegte Dissertation von mir selbständig und ohne unerlaubte Hilfe angefertigt wurde. München, 24.11.2009 Carlos Gonzalo Merino Méndez 1. Gutachter: Prof. Dr. Wolfgang Stephan 2. Gutachter: Prof. Dr. John Parsch Dissertation eingereicht: 24.11.2009 To my parents, for their support. SUMMARY 1 INTRODUCTION 3 1. COALESCENCE THEORY 4 1.1. Why use the Coalescent? 4 1.2. The Standard Neutral Model 7 1.3. Deviations from Neutrality 7 1.4. Defining the Coalescent 8 1.5. The Frequency Spectrum 8 1.6. The Effect of Recombination 9 1.7. The Coalescent and Summary Statistics 10 1.8.