On shape and structure in biological systems [Elektronische Ressource] : from biopolymers to cellular organization / vorgelegt von Karen Alim

On Shape and Structure in Biological SystemsFrom Biopolymers to Cellular OrganizationKaren AlimMunchen 2010On Shape and Structure in Biological SystemsFrom Biopolymers to Cellular OrganizationKaren AlimDoktorarbeitan der Fakultat fur Physikder Ludwig{Maximilians{UniversitatMunc henvorgelegt vonKaren Alimaus HannoverMunc hen, den 28. April 2010Erstgutachter: Prof. Dr. Erwin FreyZweitgutachter: Prof. Dr. Arezki BoudaoudTag der mundlic hen Prufung: 8. Juni 2010ContentsZusammenfassung ixAbstract xi1 Shapes and structures 12 Shape of semi exible polymer rings 92.1 Biopolymers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102.2 Exploring con gurations of biopolymers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122.3 Semi exible polymer model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142.4 Quanti cation of shape . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 162.5 Polymer ring conformations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172.6 Outlook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 222.7 K. Alim and E. Frey, Phys. Rev. Lett., 99, 198102 . . . . . . . . . . . . . . 232.8 K. Ostermeir, K. Alim, and E. Frey, Phys. Rev. E, 81, 061802 . . . . . . . 272.9 K. K. Alim, and E. Frey, Soft Matter, 6, 3467 . . . . . . . . . . 352.10 F. Drube, K. Alim, G. Witz, G. Dietler, and E. Frey, Nano Lett., 10, 1445 413 Structuring tissue by mechanics and signals 493.