Oligomerization and protein-protein interactions of the sensory histidine kinase DcuS in Escherichia coli [Elektronische Ressource] / Yun-Feng Liao

Oligomerization and Protein-ProteinInteractions of the Sensory HistidineKinase DcuS inEscherichiacoliDissertationZur Erlangung des GradesDoktor der NaturwissenschaftenAm Fachbereich Biologieder Johannes Gutenberg-Universität MainzYun-Feng Liaogeb. in Taipeh, TaiwanMainz, 2008Dekan:1. Berichterstatter:2.Tag der mündlichen Prüfung: Feb. 11, 2009iiiContentsAbstract vii1 Introduction 11.1 Two-component Regulatory Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . 11.2 DcuS and Functionally Relevant Proteins . . . . . . . . . . . . . . . 31.3 Fluorescence Spectroscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61.4 Specific Aims . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72 Theory 92.1 Fluorophores . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92.1.1 Organic Dyes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102.1.2 Cloned Fluorophores . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102.2 Fluorescence Spectroscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112.3 Resonance Energy Transfer (FRET) . . . . . . . . . . 122.3.1 Principles of FRET . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132.3.2 FRET Measurements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152.3.3 Quantitative FRET . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172.4 Degree of Oligomerization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193 Materials and Methods 213.1 Materials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213.