Methods for computer-aided chemical biology [Elektronische Ressource] : exploration of compound selectivity / vorgelegt von Dagmar Birgit Karin Stumpfe

Methods forComputer-Aided Chemical Biology:Exploration of Compound SelectivityDissertation zurErlangung des Doktorgrades (Dr. rer. nat.) derMathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakulta?t derRheinischen Friedrich-Wilhelms-Universita?t Bonnvorgelegt vonDagmar Birgit Karin Stumpfeaus BonnBonnMa?rz 2009Angefertigt mit Genehmigung der Mathematisch-NaturwissenschaftlichenFakulta?t der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universit?at BonnDiese Dissertation ist auf dem Hochschulschriftenserver der ULB Bonnhttp://hss.ulb.uni-bonn.de/diss online elektronisch publiziert.1. Referent: Univ.-Prof. Dr. rer. nat. Ju?rgen Bajorath2. Referent: Univ.-Prof. Dr. rer. nat. Michael Gu?tschowTag der Promotion: 26. Juni 2009AbstractComputationaldrugdesignanddiscoverymethodshavetraditionallyputmuchemphasis on the identification of novel active compounds and the optimizationof their potency. For chemical genetics and genomics applications, an impor-tanttaskistheidentificationofsmallmoleculesthatareselectiveagainsttargetfamilies, subfamilies, or individual targets and can be used as molecular probesfor specific functions. In order to develop or tune computational methods forsuch applications, there is a need for molecular benchmark systems that focuson compound selectivity, rather than qualitative biological activity or potency.