Méthodes statistiques pour l'analyse de données génomiques ...

´Methodes statistiques
´ ´pour l’analyse de donnees genomiques
Tests multiples en genomique´
Pierre Neuvial
http://neuvial.ensae.net
Laboratoire Statistique et Genome´
´Universite d’Evry-Val-d’Essonne, UMR CNRS 8071 - USC INRA
ENSAI — 2010/2011Tests multiples en genomique´
1 Problemes` de tests multiples
Exemples d’applications
Cadre statistique et notations
2 ´ ´Proprietes asymptotiques du FDP
Cadre d’analyse
Loi asymptotique du FDP et loi des p-valeurs en 0
Loi du FDP et loi des p-v en 1
3 ´ ´ ´Interpretation des resultats d’analyse differentielle
Enrichissement d’ensembles de genes`
´Tests multivaries sur des graphesProblemes` de tests multiples Exemples d’applications
Tests multiples en genomique´
1 `Problemes de tests multiples
Exemples d’applications
Cadre statistique et notations
2 ´ ´Proprietes asymptotiques du FDP
Cadre d’analyse
Loi asymptotique du FDP et loi des p-valeurs en 0
Loi du FDP et loi des p-v en 1
3 Interpretation´ des resultats´ d’analyse differentielle´
Enrichissement d’ensembles de genes`
Tests multivaries´ sur des graphes
P. Neuvial (Statistique et Genome)´ Methodes´ stat. pour donnees´ genomiques´ ENSAI — 2010/2011 94 / 179Problemes` de tests multiples Exemples d’applications
Exemple canonique : analyse differentielle´ de
donnees´ d’expression
´ ´Matrice de donnees d’expression (donnees de Golub)
Niveaux d’expression de m = 3051 genes` pour n = 38 echantillons´ de
deux types de leucemie´ :
AML Acute Myeloblastic Leukemia n = 111
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