Mapping the human interactome by BAC transgeneOmics and quantitative mass spectrometry [Elektronische Ressource] / Nina Christa Hubner

TECHNISCHE UNIVERSITÄT MÜNCHEN - Lehrstuhl für Proteomik - Mapping the Human Interactome by BAC TransgeneOmics and Quantitative Mass Spectrometry Nina Christa Hubner Vollständiger Abdruck der von der Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan für Ernährung, Landnutzung und Umwelt der Technischen Universität München zur Erlangung des akademischen Grades eines Doktors der Naturwissenschaften genehmigten Dissertation. Vorsitzender: Univ.-Prof. Dr. Dr. h.c. Harun Parlar Prüfer der Dissertation: 1. apl. Prof. Dr. Angelika Görg, i.R. 2. apl. Prof. Dr. Matthias Mann (Ludwig-Maximilians-Universität München) 3. Univ.-Prof. Dr. Bernhard Küster Die Dissertation wurde am 09.09.2010 bei der Technischen Universität München eingereicht und durch die Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan für Ernährung, Landnutzung und Umwelt am 20.10.2010 angenommen. Für meine lieben Eltern Christa und Alfred Hubner Table of Contents Table of Contents TABLE OF CONTENTS 1 GERMAN SUMMARY 3 PROLOGUE 7 INTRODUCTION 9 1. PROTEIN IDENTIFICATION BY MS SHOTGUN PROTEOMICS 9 2. QUANTITATIVE PROTEOMICS 10 3. BIOINFORMATIC ANALYSIS OF PROTEOMICS DATA 16 RESULTS 21 1. COMPREHENSIVE PROTEOME ANALYSIS 21 1.