Interactions of SUMO proteins [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Matthias Rabiller

Interactions of SUMO proteins Inaugural-Dissertation zur Erlangung des Doktorgrades Dr. rer. nat. des Fachbereichs Bio- und Geowissenschaften, Landschaftsarchitektur an der Universität Duisburg-Essen vorgelegt von Matthias Rabiller aus Den Haag Oktober 2005 Die der vorliegenden Arbeit zugrunde liegenden Experimente wurden am Max Planck Institut für molekulare Physiologie (Dortmund) und in der Abteilung für strukturelle und medizinische Biochemie der Universität Duisburg-Essen durchgeführt. 1. Gutachter:Prof. Dr. Peter Bayer 2. Gutachter:Prof. Dr. Tarik Moröy Vorsitzender des Prüfungsausschusses:Prof. Dr. Helmut Esche Tag der mündlichen Prüfung:16. Juni 2006 Content Abstract / Zusammenfassung1 Abbreviations 2 Introduction I)Nuclear Magnetic Resonance 1. Nature of Spin4 2. Principle of NMR5 3. 1D NMR6 4. 2D NMR can be used to observe structural changes in a protein8 5. 3D NMR and the assignment of the resonances of a protein9 II)SUMOylation 1. Post-translational Modifications12 2. Description of SUMO proteins13 3. The Sumoylation process15 4. Interactions of SUMO with other proteins19 III)Identification of a SUMO-interacting motif in non-target proteins 1. Molecular biology of SUMO interactions24 2. Aim of the present studies25 Materials & Methods 1. Cloning, Protein expression and purification for NMR studies27 2. NMR Spectra acquisition and assignment29 3.