In-vitro studies on aptamer-induced FRET between _l63_1tnN_1tn2_1tn2 [lambda_1tnN_1tn2_1tn2] tagged fluorescent protein variants [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Amrita Kuthiala

In-vitro Studies on Aptamer - Induced FRET Between λ Tagged Fluorescent N22Protein VariantsAmrita KuthialaMünchen 2010In-vitro Studies on Aptamer - Induced FRET Between λ TaggedN22Fluorescent Protein VariantsAmrita KuthialaDissertationan der Fakultät für Biologieder Ludwig-Maximilians-UniversitätMünchenAngefertigt am Max-Planck-Institutü r f Neurobiologievorgelegt vonAmrita KuthialaMünchen, September 2010Erstgutachter: Prof. Dr. Alexander BorstZweitgutachter: Prof. Dr. Rainer UhlTag der mündlichen Prüfung: 08.12.20102Contents1 Introduction 91.1 Thecentraldogmaofmolecularbiology . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91.1.1 TheRNAworld . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101.1.1.1 miRNA(micro-RNA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101.1.1.2 snRNA(smallnuclearRNA)/snoRNA(smallnucleolarRNA) . . 101.1.1.3 piRNA(PIWI-interactingRNA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111.1.1.4 rRNA(ribosomalRNA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111.1.1.5 tRNA(transferRNA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111.1.1.6 mRNA(messengerRNA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121.1.2 RegulatoryconformationalchangesinRNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121.2 RNAlocalizationandtrafficking . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131.2.1 AdvantagesofmRNAlocalization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151.2.2 mRNAlocalizationindifferentorganisms . . . . . . .