Evolution of eukaryotic introns following endosymbiotic gene transfer [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Nahal Ahmadinejad

Evolution of eukaryotic intronsfollowing endosymbioticgene transferInaugural-Dissertationzur Erlangung des Doktorgrades derMathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultätder Heinrich-Heine-Universität Düsseldorfvorgelegt vonNahal Ahmadinejadaus NeussDüsseldorf, Dezember 2008aus dem Institut für Botanik IIIder Heinrich-Heine Universität DüsseldorfGedruckt mit der Genehmigung derMathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät derHeinrich-Heine-Universität DüsseldorfReferent: Prof. Dr. W. MartinKorreferent: Prof. Dr. M. LercherTag der mündlichen Prüfung: 15.01.2009Für meine FamilieContentsList of Figures viiList of Tables ix1 Abstract 12 Zusammenfassung 33 Introduction 53.1 Introns ................................... 53.1.1 Types of Introns.......................... 53.1.2 Introns in protein coding genes................. 73.1.3 Intron characteristics ....................... 83.1.4 Distribution of introns among eukaryotes........... 103.1.5 Evolutionary origin of introns 123.1.5.1 Early views on intron evolution 123.1.5.2 Origin of spliceosomal introns ............ 123.2 Evolutionary origin of mitochondria .................. 143.2.1 Endosymbiotic gene transfer 153.2.1.1 Oxidative phosphorylation pathway ........ 173.2.1.2 Mitochondrial ribosomal proteins .......... 183.3 Goals of this study ............................ 194 Material and Methods 214.1 Sequence data ............................... 214.1.