Development of NMR methods for the study of protein folding [Elektronische Ressource] / von Kai Schlepckow

FPrudyofeiNMRStMethoofdsotfonroldingtheDevelopmentDissertationzurErlangungdesDoktorgradesderNaturwissenschaftenvorgelegtbeimFachbereichBiochemie,ChemieundPharmaziederJohannWolfgangGoethe UniversitätinFrankfurtamMainvonKAI SCHLEPCKOWausKarlsruheFrankfurtamMain2008(D30)DemFachbereichBiochemie,ChemieundPharmaziederJohannWolfgangGoethe UniversitätalsDissertationvorgelegt.Dekan: Prof.Dr.HaraldSchwalbeGutachter: Prof.Dr.HaraldSchwalbeundProf.Dr.ClemensGlaubitzDatumderDisputation:NMRunfoldedoListroftheAbbTheoreviationsplingsviidipAbstractretationixfo1.FIntroContentsductionof1cou-Kineticolarefoldingresidualofofbinterpoviner-lactalbuminrk(BLA)ramew53retical92.roteins3.p1.1. ProteinFolding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11.2. NMRspectroscopyforthestudyofproteinfolding . . . . . . . . . . . . . . 51.2.1. Foldingintermediates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51.2.2. Unfoldedstatesofproteins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61.3. Thesis: projectsandobjectives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92.1.1. TheunfoldedstateanditsstudybyNMR . . . . . . . . . . . . . . . 92.1.2. Weakalignmentandresidualdipolarcouplings . . . . . . . . . . . . 112.1.3. Prediction and simulation of residual dipolar couplings under weaklyaligningconditions .