Detecting selective sweeps in natural populations of Drosophila melanogaster [Elektronische Ressource] : methods, applications, and extensions / vorgelegt von Pavlos Pavlidis

Detecting selective sweeps in naturalpopulations of Drosophila melanogasterMethods, Applications, and ExtensionsPavlos PavlidisMu¨nchen 2010Detecting selective sweeps in naturalpopulations of Drosophila melanogasterMethods, Applications, and ExtensionsPavlos PavlidisDissertationan der Fakulta¨t fu¨r Biologieder Ludwig–Maximilians–Universita¨tMu¨nchenvorgelegt vonPavlos Pavlidisaus Athen, GriechenlandMu¨nchen, den 07.12.2010¨ERKLARUNGDiese Dissertation wurde im Sinne von §12 der Promotionsordnung von Herrn Prof. Dr.Wolfgang Stephan betreut. Ich erkla¨re hiermit, dass die Dissertation nicht einer anderenPru¨fungskommission vorgelegt worden ist und dass ich mich nicht anderweitig einerDoktorpru¨fung ohne Erfolg unterzogen habe.¨EHRENWORTLICHE VERSICHERUNGIch versichere hiermit ehrenwo¨rtlich, dass die vorgelegte Dissertation von mir selbststa¨ndig undohne unerlaubte Hilfe angefertigt wurde.Mu¨nchen, 07.12.2010Erstgutachter: Prof. Dr. Wolfgang StephanZweitgutachter: Prof. Dr. Dirk MetzlerTag der Abgabe: 07.12.2010¨ ¨Tag der mundlichen Prufung: 14.02.2011ContentsSummary xiiZusammenfassung xvDeclaration of Contributions as a co-author xviiAcknowledgements xixGeneral Introduction 1Methods for detecting selective sweeps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2Subgenomic data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3Genome-wide data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .