Computational analysis of alternative spliting in human and mice [Elektronische Ressource] / von Ralf H. Bortfeldt

Computational Analysis of AlternativeSplicing in Human and MiceDissertationzur Erlangung des akademischen Gradesdoctor rerum naturalium (Dr. rer. nat.)vorgelegt dem Rat der Biologisch-Pharmazeutischen Fakultatder Friedrich-Schiller-Universitat Jenavon MSc Ralf H. Bortfeldtgeboren am 16. Februar 1977 in BerlinDie vorliegende Arbeit wurde am Lehrstuhl fur Bioinformatik der biologisch-pharmazeutischen Fakult at der Friedrich Schiller Universit at unter Leitung vonProf. Dr. Stefan Schuster angefertigt.Gutachter:1. Prof. Dr. Stefan Schuster, Friedrich Schiller Universit at Jena2. PD Dr. Matthias Platzer, FLI - Leibniz-Institut fur Altersforschung Jena3. PD Dr. Jurgen Kle e, Institut fur Molekularbiologie und BioInformatik,Charite Campus Benjamin Franklin, BerlinTag der o en tlichen Verteidigung: 04. Mai 2009SummaryThe presented dissertation focuses on the computational analysis of the molec-ular biological mechanism called Alternative Splicing and integrates the topicsPrediction and validation of alternative splice forms\, Characterization and" "0functional impact of short 5 splice site (ss) variations\ and Petri Net modeling"of the spliceosomal assembly pathway\. In the rst part di erent features wereanalyzed in their potential to distinguish two classes of splice sites, alternativeand reference splice sites.