Computational analysis and interpretation of prokaryotic high-throughput expression data [Elektronische Ressource] / von Maurice Patrick Scheer

Computational Analysis and Interpretation ofProkaryotic High-throughput Expression DataVon der Fakult¨at fur¨ Lebenswissenschaftender Technischen Universit¨at Carolo-Wilhelminazu Braunschweigzur Erlangung des Grades einesDoktors der Naturwissenschaften(Dr. rer. nat.)genehmigteDissertationvon Maurice Patrick Scheeraus Berlin1. Referent: Prof. Dr. Michael Steinert2.t: Prof. Dr. Frank Klawonneingereicht am: 25.06.2008mundlic¨ he Prufung¨ (Disputation) am: 11.09.2008Druckjahr 2008Nina und BrunoIVorveroffen¨ tlichungen der Dissertation:TeiledieserArbeitwurdenmitGenehmigungderFakultatfurLebenswissenschaften,ver-¨ ¨treten durch den Mentor der Arbeit, in folgenden Beitragen¨ vorab veroffen¨ tlicht:Publikationen:Hiller, K., Grote, A., Scheer, M., Munch, R. & Jahn, D. (2004) PrediSi: predic-¨tion of signal peptides and their cleavage positions. Nucleic Acids Res.32, W375–W379.Grote, A., Hiller, K., Scheer, M., Munch, R., Nortemann, B., Hempel, D.C.¨ ¨& Jahn, D. (2005) JCat: a novel tool to adapt codon usage of a target gene to itspotential expression host. Nucleic Acids Res. 33, W526–W531.Munch, R., Hiller, K., Grote, A., Scheer, M., Klein, J., Schobert, M. & Jahn,¨D. (2005) Virtual Footprint and PRODORIC: an integrative framework for regulon pre-diction in prokaryotes. Bioinformatics 21, 4187–4189.Scheer, M., Klawonn, F., Munc¨ h, R., Grote, A., Hiller, K., Choi, C., Koch,I., Schobert, M., Hartig, E., Klages, U. & Jahn, D.