Complex formation of AID and its function in innate immunity [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Mirjam Metzner

Complex Formation of AID and its Function in Innate Immunity Der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg zur Erlangung des Doktorgrades vorgelegt von Mirjam Metzner aus Würzburg Als Dissertation genehmigt von der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Universität Erlangen-Nürnberg Tag der mündlichen Prüfung: 05. Juli 2010 Vorsitzender der Promotionskommission: Prof. Dr. E. Bänsch Erstberichterstatter: Prof. Dr. H.-M. Jäck Zweitberichterstatter: Prof. Dr. T. Winkler FOR MY PARENTS Table of Contents ________________________________________________________________________ TABLE OF CONTENTS 1 ZUSAMMENFASSUNG 1 SUMMARY 2 2 INTRODUCTION 3 2.1 Adaptive and innate immunity 3 2.2 B cell development and activation 3 2.3 Activation-induced cytidine deaminase (AID) 4 2.3.1 AID in adaptive immunity 4 2.3.2 Basic facts about AID 5 2.3.3 APOBEC family of cytidine deaminases 6 2.3.4 AID cofactors 8 2.3.5 AID multimers and complexes 8 2.3.6 AID and RNA 9 2.3.7 AID deficiency and autoimmune disease 10 2.3.8 AID in innate immunity 11 2.3.8.1 AID protects from viral infection 11 2.3.8.2 AID inhibits L1 retrotransposition 12 2.4 Endogenous retroelements 13 2.4.1 L1 elements 13 2.4.1.1 The L1 retrotransposition cycle 14 2.4.1.2 Expression pattern 15 2.4.1.3 Restriction of L1 activity 15 2.4.