Classical and hybrid modeling of gene regulatory networks [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Zeiser Stefan

Classical and Hybrid Modeling ofGene Regulatory NetworksI n a u g u r a l d i s s e r t a t i o nzurErlangung des akademischen Grades einesDoktors der NaturwissenschaftenderMathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultat¨derErnst-Moritz-Arndt-Universitat¨ Greifswaldvorgelegt vonStefan Zeisergeboren am 02.05.1970in HerbolzheimKonstanz, 30.06.2009Dekan:. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1. Gutachter:. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2. Gutachter:. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Tag der Promotion:. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .AbstractWe present classical and hybrid modeling approaches for genetic regulatory net-works focusing on promoter analysis for negatively and positively autoregulatednetworks. The main aim of this thesis is to introduce an alternative mathemati-cal approach to model gene regulatory networks based on piecewise deterministicMarkov processes (PDMP).During somitogenesis, a process describing the early segmentation in vertebrates,molecular oscillators play a crucial role as part of a se clock.