C/EBPbeta deltauORF mice - a genetic model for uORF-mediated translational control in mammals [Elektronische Ressource] / Klaus Wethmar. Gutachter: Achim Leutz ; Claus Scheidereit ; Thomas Sommer

Aus dem Max-Delbrück-Centrum für molekulare Medizin uORFC/EBP mice – a genetic model for uORF-mediated translational control in mammals Dissertation zur Erlangung des akademischen Grades doctor rerum naturalium (Dr. rer. nat.) im Fach Biologie eingereicht an der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät I der Humboldt-Universität zu Berlin von Dr. med. Klaus Wethmar Präsident der Humboldt-Universität zu Berlin Prof. Dr. Dr. h.c. Christoph Markschies Dekan der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät I Prof. Dr. Andreas Herrmann Gutachter: 1. Prof. Dr. Achim Leutz 2. Prof. Dr. Claus Scheidereit 3. Prof. Dr. Thomas Sommer Tag der mündlichen Prüfung: 28. März 2011 Table of contents Table of contents 2 Zusammenfassung 4 Abstract 5 Dedication 7 List of abbreviations 8 1 Introduction 11 1.1 Translational regulation of protein expression 11 1.1.1 Mechanisms of translational control 11 1.1.2 Translational control by upstream open reading frames 14 1.1.2.1 Variable presence of uORFs in alternative transcripts 15 1.1.2.2 Length, position and initiation codon context 15 1.1.2.3 Upstream ORFs integrate the general translational status of a cell 17 1.1.2.4 Upstream ORF-encoded peptides 18 1.1.2.5 Nonsense-mediated mRNA decay 19 1.1.2.6 Variables affecting the degree of uORF-mediated MCS repression 20 1.2 CCAAT/enhancer binding proteins 21 1.2.1 Family overview 21 1.2.