Analysis of gene expression data by systems biology methods [Elektronische Ressource] / presented by Yvonne Koch

Dissertation submitted to the Combined Faculties for the Natural Sciences and for Mathematics of the Ruperto Carola University of Heidelberg, Germany for the degree of Doctor of Natural Sciences presented by Dipl. Inf. Yvonne Koch born in: Ulm, Germany thOral-examination: 5 of April 2011 1 2 Analysis of Gene Expression Data by Systems Biology Methods Referees: PD Dr. Rainer König Prof. Dr. Ursula Kummer 3 4 Eidesstattliche Erklärung Hiermit erkläre ich, Yvonne Koch, an Eides Statt, dass ich die an der Universität Heidel-berg vorgelegte Dissertation selbständig und ohne Benutzung anderer als der angegebe-nen Hilfsmittel angefertigt habe. Die aus fremden Quellen übernommenen Gedanken sind als solche kenntlich gemacht. Die Arbeit wurde bisher in gleicher oder ähnlicher Weise keiner anderen Prüfungsbehör-de vorgelegt und auch nicht veröffentlicht. Heidelberg, den 22. Februar 2011 __________________________ Unterschrift 5 6 Acknowledgements First of all, I would like to thank Professor Dr. Roland Eils who gave me the opportunity to do my PhD in the exciting field of systems biology at the Department of Theoretical Bioinformatics at the German Cancer Research Center. The support and freedom he granted enabled me to conduct a research project of interests. I am grateful to PD Dr.