Alternative splicing regulation in the human system [Elektronische Ressource] : mechanistic studies of hnRNP L and CA-rich elements / vorgelegt von Monika Heiner

Alternative splicing regulation in the human system: Mechanistic studies of hnRNP L and CA-rich elements Dissertation zur Erlangung des akademischen Grades des Doktors der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat.) eingereicht im Fachbereich Biologie und Chemie der Justus-Liebig-Universität Gießen vorgelegt von Monika Heiner aus Marburg Gießen, Dezember 2008 Die vorliegende Arbeit wurde am Institut für Biochemie des Fachbereichs 08 der Justus-Liebig-Universität Gießen in der Zeit von August 2004 bis Dezember 2008 unter der Leitung von Prof. Dr. Albrecht Bindereif angefertigt. Dekan: Prof. Dr. Peter R. Schreiner Institut für Organische Chemie Justus-Liebig-Universität Gießen 1. Gutachter: Prof. Dr. Albrecht Bindereif Institut für Biochemie Justus-Liebig-Universität Gießen 2. Gutachter: Prof. Dr. Rainer Renkawitz Institut für Genetik Justus-Liebig-Universität Gießen Contents Contents CONTENTS I ZUSAMMENFASSUNG V SUMMARY VII 1. INTRODUCTION 1 1.1 Splicing of RNA 1 1.2 The splicing reaction 2 1.3 Spliceosome assembly 3 1.4 Alternative splicing 5 1.5 Splicing enhancer and silencer 7 1.6 Trans-acting factors 8 1.7 HnRNP L 11 1.8 Splicing and disease 13 1.9 Global analysis of alternative splicing 14 1.10 Aim of the work 15 2. MATERIALS AND METHODS 17 2.1 Materials 17 2.1.1 Chemicals and reagents 17 2.1.