Accurate charge densities of amino acids and peptides by the maximum entropy method [Elektronische Ressource] / von Jeanette Netzel

Accurate charge densities of aminoacids and peptides by the MaximumEntropy MethodVon der Universität Bayreuthzur Erlangung des Grades einesDoktors der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat.)genehmigte AbhandlungvonJeanette Netzelaus Bergen1. Gutachter: Prof. dr. S. van Smaalen2. Gutachter: Prof. Dr. P. LugerTag der Einreichung: 15. August 2008Tag des Kolloquiums: 15. Januar 20092ContentsPublications 81 Introduction 92 The Maximum Entropy Method 132.1 Applications of the MEM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132.2 Accurate charge densities by the MEM . . . . . . . . . . . . . . . . . 152.2.1 Principle of the MEM - BayMEM . . . . . . . . . . . . . . . . 152.2.2 Extensions to the MEM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 182.2.3 The Atoms in Molecules Theory . . . . . . . . . . . . . . . . . 222.2.4 Summary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 233 Accurate charge density of trialanine 253.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263.2 The maximum entropy method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273.3 Experimental . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293.3.1 Refinement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293.3.2 MEM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303.4 Results and discussion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 373.4.1 Atom charges and volumes . . . . . . . . . . . . . . . . . .