Fiche TD avec le logiciel tdr35

• fiche - matière potentielle : td avec le logiciel

Fiche TD avec le logiciel : tdr35 ————— Rapports de vraisemblance J.R. Lobry, D. Chessel & A.B. Dufour ————— Rapports de vraisemblance et Khi2. Tests du rapport de vraisem- blance. Une experience entomologique. Table des matieres 1 Introduction 1 2 La loi du rapport a la vraisemblance maximale 2 3 Un parametre et k groupes 8 4 Le G2 d'une table de contingence 17 5 Un probleme entomologique 19 References 33 1 Introduction On extrait des donnees (Table 1) de l'exemple du logiciel whichrun [2], ce sont les frequences alleliques du locus microsatellite OTS-2 dans 5 populations du Saumon quinnat a montaison hivernale, Oncorhynchus tshawytscha. Sachant que les hypotheses du modele de Hardy-Weinberg sont satisfaites, estimer au maximum de vraisemblance a laquelle des 5 populations appartient un individu heterozygote type 066-070. La probabilite que l'individu porte un couple d'alleles ab est 2P (a)P (b), donc les vraisemblances (probabilite du resultat sous l'hypothese que l'individu appartienne a une population donnee) est : a <- c(0.038, 0.002, 0.053, 0.066, 0.8) b <- c(0.263, 0.297, 0.447, 0.368, 0.119) round(2 * a * b, dig = 3) [1] 0.020 0.001 0.047 0.049 0.190 1

• pest


• delta


• necha


• frequences alleliques du locus microsatellite


• hypotheses du modele de hardy-weinberg


• xmax


• individu homozygote


• distribution d'echantillonnage