Formation CSAGAD IE oct
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Niveau: ElementaireFormation CSAGAD / IE – 13 oct 2009 L'indexation sur les contrôles élémentaires : démarches et principes de la méthode Hélène Leclerc (Institut de l'Elevage) contrôle laitier évaluation géné genetic evaluation données lactation au contrôles élémentaires indexation sur les contrôle élémentaires institut de l'elevage estimation
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L’indexation sur les contrôles élémentaires : démarches et principes de la méthode
Hélène Leclerc (Institut de l’Elevage)
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Le contexte
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Estimation perf305 joursutilisé pour évaluation génétique
Estimation de la valeur génétique
Performances enregistrées par le Contrôle Laitier
conseiller les éleveurs à partir desdonnées enreg.
ontiu a lestaacd seénnoDtaires sléméneoctnôrel
des donnéesenreg.
Conseiller les éleveurs à partir des donnéesenreg.
Estimationplus précise de la valeur génétique
Performances enregistrées par le Contrôle Laitier
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utilisedirect perfs enreg. évaluation G sur contrôles élémentaires
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Des donatitnoa énsel cas leémélcou rôntatneseri
La méthodologie
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Données longitudinales
On dit de données qu’elles sont « longitudinales » quand ces données sont des mesures sur unmême individurépétéesdans le temps
En élevage, c’est le cas de nombreux caractères = Croissance d’un animal (mesurée de façon régulière) Sa production (lait, œuf, laine) L’ingestion journalière
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Les modèles de contrôles élémentaires
Données =mesures répétées imposent de tenir compte de larépétabilitédes mesures
Deux approches possibles: modèle multicaractère= les différentes mesures correspondent àdes caractères différents mais génétiquement corrélés (ex : croissance en bovins allaitant) modèle contrôles élémentaires(TDM) = les différentes mesures correspondent àun même caractèremais dont la structure des covariances évolue au cours du temps. (Régression Aléatoire ou Fonction de covariance)
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Production journalière de lait
Production 305 joursestimée Fleischmann= 9181 Kg
Production 305 joursvraie = 9144 Kg
356595125155185215245275305 Stade de lactation
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Evaluation génétique à partir de laproduction cumulée sru, MP3,0T5B ,j oTuPr)s (Lait, MG
Exemple : la vache précédente qui a produit9181 kgde Lait
Lactation
Evaluation génétique à partir des productions journalière de Lait, MG, MP, taux dechacun des contrôles (1 lactation ≈ 10 données) Stade (j) Lait (Kg) Stade (j) Lait (Kg) 13 32.5 186 30.9 55 35.4 219 30.0 87 33.3 249 25.0 113 32.5 280 24.3 147 31.3 305 25.6
Contrôles élémentaires
Modélisation de la production
Modèle contrôles élémentaires = 2 séries de régressions sur le stade de lactation
Rgéerssion fixe
Décrit la forme générale de la courbe de lactation en fonction d’un groupe de référence (région de production, âge et mois de vêlage…)
+
Régression aléatoire
Décrit la déviation par rapport à la courbe de référence (variable suivant le stade de lactation) spécifique à l’animal (effet génétique et environnement permanent)
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production observée
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Courbes paramétriques
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Différents types de modélisation
52k 2g 0kg15 kg100150252000030ruoJed sac ltita (ont)i & SchaAl3)50nl)(feef:r220553tdte5l3030n(nimlct:kbtctiWya
